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翼和SNP分型技術(shù)(二):Hi-SNP技術(shù)
發(fā)布時(shí)間: 2025-11-05 點(diǎn)擊次數(shù): 142次選擇SNP分型服務(wù),可根據(jù)實(shí)驗(yàn)規(guī)模決定。PCR-LDR技術(shù)適用于中低通量檢測(cè),能精準(zhǔn)滿足小規(guī)模實(shí)驗(yàn)需求;基于二代測(cè)序的Hi-SNP技術(shù)則適合高通量檢測(cè),為大規(guī)模實(shí)驗(yàn)提供高效方案。
1. Hi-SNP分型服務(wù)技術(shù)路線:

2. 分型流程
a. 位點(diǎn)評(píng)估:確認(rèn)物種,版本,基因或序列信息,對(duì)SNP位點(diǎn)的同源性,(高同源不適合該方法檢測(cè)SNP,本公司有針對(duì)該狀況的特色服務(wù)),GC含量(含量過高可能導(dǎo)致檢測(cè)失敗)等進(jìn)行評(píng)估,確定可行性。
b. 樣本質(zhì)控:電泳及濃度綜合質(zhì)控,不合格的樣本反饋給客戶。單管操作,樣本消耗量少,100ng樣本就能做幾十上百個(gè)SNP。
c. 引物設(shè)計(jì)合成:根據(jù)擴(kuò)增子設(shè)計(jì)并合成引物。
d. 擴(kuò)增階段:調(diào)整各對(duì)引物的體積及反應(yīng)條件,使得每對(duì)引物的擴(kuò)增效率相當(dāng),同時(shí)擴(kuò)增多個(gè)目標(biāo)DNA片段。
e. 樣本建庫(kù):根據(jù)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行建庫(kù),加測(cè)序接頭,用不同barcode來區(qū)分,為測(cè)序做準(zhǔn)備。
f. 測(cè)序及數(shù)據(jù)分析:在illumina novaseq pe150 平臺(tái)上,對(duì)擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測(cè)序,然后對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行分析,出率不足的(95%以上)要補(bǔ)數(shù)據(jù)。完成實(shí)驗(yàn)報(bào)告。
3. 翼和特色
● 自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的多重PCR為基礎(chǔ),技術(shù)先進(jìn),結(jié)果準(zhǔn)確
● 通量高,SNP位點(diǎn)30-500個(gè)之間,數(shù)百數(shù)千樣本推薦使用
● 平均測(cè)序深度1000倍,每個(gè)SNP位點(diǎn)測(cè)序深度至少幾百倍
● 適用性廣,適用于任何多態(tài)性位點(diǎn)
● 對(duì)SNP位點(diǎn)以及周圍序列進(jìn)行測(cè)序,更準(zhǔn)確,更靈敏
● 測(cè)序質(zhì)量Q30>90%
● 檢出率95%以上
● 準(zhǔn)確率>98%
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